param = job_view_cortex_INIT_PARAMETER 初期パラメタの設定 Copyright (C) 2011, ATR All Rights Reserved. License : New BSD License(see VBMEG_LICENSE.txt)
0001 function param = job_view_cortex_INIT_PARAMETER 0002 % param = job_view_cortex_INIT_PARAMETER 0003 % 0004 % 初期パラメタの設定 0005 % 0006 % 0007 % Copyright (C) 2011, ATR All Rights Reserved. 0008 % License : New BSD License(see VBMEG_LICENSE.txt) 0009 0010 % param.LRflg : 描画する大脳半球の選択 0011 % 'L' --- 左半球のみ 0012 % 'R' --- 右半球のみ 0013 % 'LR' --- 両半球, デフォルト 0014 0015 param.LRflg = 'LR'; 0016 0017 0018 % param.model_type : 描画する皮質モデルのタイプ 0019 % 'original' --- 通常表示 (皮質表面の3次元表示), デフォルト 0020 % 'inflate' --- inflate表示 (.inflate.matファイルのロードが必要) 0021 % .inflate.matロード時に自動的に選択 0022 0023 param.model_type = 'inflate'; 0024 0025 0026 % param.sulcus_visibility : inflate表示の場合、溝を表示するかどうか 0027 % 'visible' --- 表示する、 デフォルト 0028 % 'invisible' --- 表示しない 0029 0030 param.sulcus_visibility = 'visible'; 0031 0032 0033 % param.brain_color : 皮質の色 0034 % TrueColor ( デフォルトは [0.8 0.8 0.8] ) 0035 0036 param.brain_color = [0.8 0.8 0.8]; 0037 0038 0039 % param.sulcus_color : inflate表示で溝を表示する場合の色 0040 % TrueColor ( デフォルトは [0.6 0.6 0.6] ) 0041 0042 param.sulcus_color = [0.6 0.6 0.6]; 0043 0044 0045 % param.lighting : ライティングをするかどうか 0046 % 'on' --- ライティングあり, デフォルト 0047 % 'off' --- ライティングなし 0048 0049 param.lighting = 'on'; 0050 0051 0052 % param.act_area_priority : 活動強度と領域のどちらを上に表示するか 0053 % 'activation' --- 活動強度を上に表示, デフォルト 0054 % 'area' --- 領域を上に表示l 0055 0056 param.act_area_priority = 'activation'; 0057 0058 0059 % param.act_normalize : 活動強度を正規化するかどうか 0060 % 'no' --- 正規化しない, デフォルト 0061 % 'meshsize' --- 脳モデルのメッシュサイズで正規化 0062 0063 param.act_normalize = 'no'; 0064 0065 0066 % param.act_relative_mode : 活動強度の最大絶対値の計算法 0067 % 'all' --- .act.matファイル中のすべてのデータの最大絶対値 0068 % 'each' --- 表示中のデータの最大絶対値, デフォルト 0069 0070 param.act_relative_mode = 'each'; 0071 0072 0073 % param.act_min_mode : 描画する活動強度の最小絶対値の設定方法 0074 % 'absolute' --- 即値で指定 0075 % 'relative' --- 最大絶対値に対する割合で指定, デフォルト 0076 0077 param.act_min_mode = 'relative'; 0078 0079 0080 % param.act_min : 描画する活動強度の最小絶対値 0081 % param.act_min_mode = 'absolute' の場合は即値 0082 % param.act_min_mode = 'relative' の場合は最大絶対値に対する割合 0083 % ( デフォルトは0.1 ) 0084 0085 param.act_min = 0.1; 0086 0087 0088 % param.act_sign_mode : 0089 % param.act_colormap_max_mode : 0090 % param.act_colormap_max : カラー軸の設定 0091 % act_sing_mode = 'signed' なら、カラー軸の範囲は [ -cmax, cmax ] 0092 % act_sing_mode = 'unsigned' なら、カラー軸の範囲は [ 0, cmax ] 0093 % ただし、cmaxは、act_colormap_max_mode が、 0094 % 'absolute' なら、cmax = act_colormap_max 0095 % 'relative' なら、cmax = act_colormap_max × 最大絶対値 0096 % デフォルトは、 0097 % act_sign_mode = 'unsigned' 0098 % act_colormap_max_mode = 'relative' 0099 % act_colormap_max = 1 0100 0101 param.act_sign_mode = 'unsigned'; 0102 param.act_colormap_max_mode = 'relative'; 0103 param.act_colormap_max = 1; 0104 0105 0106 % param.act_colormap_type : カラーマップのタイプ 0107 % 'jet' --- jet タイプ, デフォルト 0108 % 'hot' --- hot タイプ 0109 0110 param.act_colormap_type = 'jet'; 0111 0112 0113 % param.act_show_highlight : 活動強度のハイライト(Plot List内の選択時強調) 0114 % 'on' --- ハイライトあり, デフォルト 0115 % 'off' --- ハイライトなし 0116 % ハイライトされたもの以外が透明に表示される 0117 0118 param.act_show_highlight = 'on'; 0119 0120 0121 % param.act_non_highlight_alpha : ハイライトされたもの以外の活動強度の透明度 0122 % 0.01 〜 0.99 のスカラ値 ( デフォルトは 0.5 ) 0123 0124 param.act_non_highlight_alpha = 0.5; 0125 0126 0127 % param.area_alpha : 領域表示の透明度 0128 % 0.01 〜 0.99 のスカラ値 ( デフォルトは 0.4 ) 0129 0130 param.area_alpha = 0.4; 0131 0132 0133 % param.area_show_highlight : 領域のハイライト(Plot List内の選択時強調) 0134 % 'on' --- ハイライトあり, デフォルト 0135 % 'off' --- ハイライトなし 0136 0137 param.area_show_highlight = 'on'; 0138 0139 0140 % param.selection_radius : マウスによる領域選択時の選択半径(mm) 0141 % スカラ値 ( デフォルトは 5 ) 0142 0143 param.selection_radius = 5; 0144 0145 0146 % param.selection_color : 領域選択時の色 0147 % TrueColor ( デフォルトは [ 1 1 1 ] ) 0148 0149 param.selection_color = [ 1 1 1 ]; 0150 0151 0152 % param.selection_undo_length : 領域選択のアンドゥ履歴の最大数 0153 % 正数 ( デフォルトは 100 ) 0154 0155 param.selection_undo_length = 100; 0156 0157 0158 % param.dilation_erosion_radius : 選択領域の膨張/収縮時の幅(mm) 0159 % スカラ値 ( デフォルトは 3 ) 0160 0161 param.dilation_erosion_radius = 3; 0162 0163 0164 % param.paint : 活動強度, 領域, 選択領域の描画方法 0165 % 'patch' --- patch(面)で描画 0166 % 'dot' --- plot(点)で描画 0167 0168 param.paint = 'patch'; 0169 0170 0171 % param.markersize : 点描画時のマーカーの大きさ 0172 % スカラ値 ( デフォルトは 1 ) 0173 0174 param.markersize = 1;